Τα περισσότερα από αυτά τα κτίρια δεν είναι ανοικτά στο κοινό, ενώ για κάποια άλλα θα χρειαστείτε ειδική άδεια. Η μερικώς αναστηλωμένη Νότια Οικία ήταν τριώροφο σπίτι, το οποίο κατασκευάστηκε στο τέλος της Μεσομινωικής περιόδου (1600 π.Χ.) και πιθανόν να ανήκε σε κάποιον ευγενή ή επίσημο Μινωίτη. Στη Νοτιοανατολική Οικία βρέθηκε μια τράπεζα προσφορών και ένα ιερό.

Εκτός του περιφραγμένου αρχαιολογικού χώρου, νότια από το ανάκτορο, βρίσκεται το Καραβάν Σεράι, όπου βρέθηκε η θαυμάσια τοιχογραφία με τις πέρδικες και τους τσαλαπετεινούς ( το πρωτότυπο βρίσκεται στο Αρχαιολογικό Μουσείο Ηρακλείου). Σε αυτό το οικοδόμημα οι ταξιδιώτες ή οι επισκέπτες καθαρίζονταν στις πήλινες μπανιέρες που βρέθηκαν εκεί, πριν παρουσιαστούν στο ανάκτορο.

Η Βασιλική Έπαυλη (14ος αι. π.Χ.) βρίσκεται βορειοανατολικά του ανακτόρου κοντά στον Ανατολικό Προμαχώνα. Σε αυτή βρέθηκαν εκτός των άλλων μια Αίθουσα Θρόνου και μια Υπόστυλη Κρύπτη, όπου γίνονταν οι προσφορές.

Βορειοδυτικά του ανακτόρου βρίσκεται η Οικία των Τοιχογραφιών που πήρε το όνομά της από τις υπέροχες τοιχογραφίες που βρέθηκαν στις αίθουσές της.

Το Μικρό Ανάκτορο (1600-1400 π.Χ.) βρίσκεται στον πλακόστρωτο δρόμο βορειοδυτικά του κυρίως ανακτόρου. Το οικοδόμημα αυτό παρουσιάζει αρχιτεκτονικά πολλές ομοιότητες με το ανάκτορο της Κνωσού. Είχε περίστυλη αίθουσα και χρησιμοποιήθηκε και την Ρωμαϊκή εποχή. Σε μια αίθουσα του βρέθηκε το περίφημο ρυτό με κεφάλι ταύρου από στεατίτη που εκτίθεται σήμερα στο Αρχαιολογικό Μουσείο Ηρακλείου.

Σε απόσταση περίπου 600 μ. του κυρίως ανακτόρου βρίσκεται ο Βασιλικός Τάφος -; Ιερό (17ος -;14ος αι. π.Χ.) με διάφορους θαλάμους, υπόστυλη κρύπτη και ιερό.

Η Οικία του Αρχιερέα βρίσκεται 300 μ. από το Καραβάν Σεράι και επικοινωνούσε με τον Βασιλικό Τάφο μέσω ενός πλακόστρωτου δρόμου. Σε αυτό το οίκημα βρέθηκε ένας Πέτρινος Βωμός, ο οποίος είχε ένα χώρισμα με δυο κολόνες. Τον Βωμό πλαισιώνουν διάφορες βάσεις διπλών Πελέκεων και μια τράπεζα προσφορών.

Κοντά στην είσοδο του αρχαιολογικού χώρου, στον δρόμο που οδηγεί στο Ηράκλειο βρίσκεται η Βίλα Αριάδνη. Κατασκευάστηκε από τον Έβανς, ο οποίος έζησε εκεί κατά τη διάρκεια των ανασκαφών της Κνωσού.